196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1143 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  100 
 
 
584 aa  1172  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  44.5 
 
 
588 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  48.2 
 
 
595 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  42.65 
 
 
585 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  45.88 
 
 
608 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  44.66 
 
 
595 aa  399  1e-110  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  43.44 
 
 
568 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  43.24 
 
 
568 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  39.25 
 
 
692 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  41.13 
 
 
580 aa  357  3e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.28 
 
 
1391 aa  340  3e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.76 
 
 
1349 aa  338  1e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.94 
 
 
1570 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  38.51 
 
 
585 aa  309  1e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.75 
 
 
584 aa  308  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.75 
 
 
639 aa  307  4e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  35 
 
 
587 aa  260  5e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  31.84 
 
 
579 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.46 
 
 
533 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.8 
 
 
558 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.14 
 
 
546 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.24 
 
 
561 aa  134  7e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
569 aa  133  1e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.35 
 
 
747 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  28.63 
 
 
553 aa  116  9e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.25 
 
 
583 aa  115  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.48 
 
 
572 aa  114  4e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.9 
 
 
567 aa  114  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  25.05 
 
 
569 aa  113  1e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.21 
 
 
576 aa  113  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  24.59 
 
 
550 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.86 
 
 
568 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.05 
 
 
568 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.58 
 
 
554 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  23.45 
 
 
562 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.9 
 
 
573 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  23.45 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  3.23092e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  26.79 
 
 
582 aa  104  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  23.03 
 
 
562 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  22.81 
 
 
562 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.41 
 
 
554 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  23.95 
 
 
531 aa  100  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 
586 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.94 
 
 
585 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.47 
 
 
547 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.36 
 
 
607 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  24.05 
 
 
543 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.59 
 
 
568 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.91 
 
 
557 aa  97.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.61 
 
 
567 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  22.97 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  38.71 
 
 
143 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.65 
 
 
554 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.83 
 
 
553 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  22.18 
 
 
583 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  22.4 
 
 
567 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  23.52 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.52 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.02 
 
 
574 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 
552 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22 
 
 
567 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.31 
 
 
554 aa  91.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22 
 
 
567 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.24 
 
 
583 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  22.75 
 
 
550 aa  90.5  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.8 
 
 
538 aa  90.1  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.44 
 
 
591 aa  90.1  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.44 
 
 
591 aa  90.1  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.94226e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.93 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  23.52 
 
 
596 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.82 
 
 
554 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  23.56 
 
 
556 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.46 
 
 
554 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  24.67 
 
 
590 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.57 
 
 
575 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.21 
 
 
585 aa  86.3  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.91 
 
 
554 aa  86.7  1e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.9 
 
 
541 aa  85.9  2e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  23.72 
 
 
545 aa  84.7  4e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.21 
 
 
538 aa  85.1  4e-15  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.73 
 
 
590 aa  84.3  5e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.83 
 
 
692 aa  82.4  2e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.09 
 
 
599 aa  82.4  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  21.06 
 
 
555 aa  81.6  4e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  23.41 
 
 
581 aa  79.7  1e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.39 
 
 
559 aa  79  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  24.18 
 
 
442 aa  78.6  3e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  25.74 
 
 
575 aa  78.6  3e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.43 
 
 
608 aa  77.8  6e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.8 
 
 
549 aa  77  8e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.79 
 
 
592 aa  77  1e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.68 
 
 
548 aa  75.5  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  23.15 
 
 
551 aa  75.5  3e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  22 
 
 
624 aa  75.1  3e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  23.96 
 
 
593 aa  75.1  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  23.15 
 
 
551 aa  74.7  4e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  23.15 
 
 
551 aa  74.7  4e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  23.15 
 
 
551 aa  74.7  4e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.15 
 
 
559 aa  74.7  4e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.28 
 
 
591 aa  74.7  4e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.38882e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>