More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0623 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 453 aa  929    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  56.64 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  53.23 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  52.48 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  50.97 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  46.52 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  47.24 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  44.92 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  44.74 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  42.7 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  41.93 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 485 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.68 
 
 		 476 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 476 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.63 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 728 aa  123  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 518 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  37.58 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  22.07 
 
 		 499 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 463 aa  86.3  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.63 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.47 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 800 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.24 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  26.92 
 
 		 275 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  23.56 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.88 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.92 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.92 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.62 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.62 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.62 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  22.75 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.36 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  21.24 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  22.16 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>