98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3924 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  487  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  68.6 
 
 		 273 aa  311  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  39.46 
 
 		 333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  35.84 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  37.84 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  35.55 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  35.52 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  37.43 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  27 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.87 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  31.37 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  34.22 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.24 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  35.19 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  27.36 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  33.57 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  36.21 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  34.46 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.53 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 338 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  32.6 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.29 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.48 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  32.91 
 
 		 371 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.07 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.73 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  36.04 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 		 350 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  28.87 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.22 
 
 		 363 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.81 
 
 		 367 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  26.28 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  24.89 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  31.96 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  25.09 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  30.99 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  26.49 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  23.99 
 
 		 350 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.22 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 368 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 365 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.18 
 
 		 331 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  25.18 
 
 		 345 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  25.18 
 
 		 359 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  26.91 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  27.62 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.83 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  35 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  30.21 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  31.85 
 
 		 331 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  23.21 
 
 		 344 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  32.86 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.32 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.87 
 
 		 337 aa  46.6  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  29.26 
 
 		 362 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  26.59 
 
 		 344 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  26.91 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.73 
 
 		 334 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  35.2 
 
 		 344 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  25.13 
 
 		 316 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  25.9 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  25.41 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  27.22 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1900  ApbE-like lipoprotein  34.38 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  0.0133899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  37.36 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  30.6 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  36.26 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  24.5 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  26.06 
 
 		 345 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  23.92 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  29.61 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.07 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.63 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  37.62 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.82 
 
 		 340 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.64 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  27.14 
 
 		 389 aa  42  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  24.17 
 
 		 342 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.71 
 
 		 328 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>