279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0233 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  100 
 
 		 293 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  72.59 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  51.32 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  47.47 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  46.88 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  47.09 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  43.72 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  36.02 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  36.6 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  37.58 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  28.73 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  26.02 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  37.43 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  39.5 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  42.28 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.95 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  33.97 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  34 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.94 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  35.29 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.91 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  42.67 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  32.24 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  39.1 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  34.05 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  42.75 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  39.71 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1758  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.16 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  39.5 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.62 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.16 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  36.43 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.14 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.86 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.14 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  37.44 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  36.26 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  36.64 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  36.76 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.12 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.16 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.16 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.16 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.89 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.52 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  30.32 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  33.07 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.62 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  33.95 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  41.54 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.62 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  22.75 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.57 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.63 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.06 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  30.39 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  30.32 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.32 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  37.34 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  37.34 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.68 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  40.15 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  37.34 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  37.34 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  29.55 
 
 		 379 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  33.12 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.05 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  33.58 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  35.66 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  30.13 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  35.29 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  34.55 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  37.21 
 
 		 800 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.72 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  34.15 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  37.5 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  25.9 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.13 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  33.63 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  29.03 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>