295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0382 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 237 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  43.93 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  42.08 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  42.29 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  39.65 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  45.37 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  40.09 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.15 
 
 		 350 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.86 
 
 		 336 aa  92  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.19 
 
 		 363 aa  89  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  33.73 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  37.34 
 
 		 353 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.62 
 
 		 357 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  39.76 
 
 		 386 aa  88.6  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  26.62 
 
 		 344 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  30.68 
 
 		 315 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  30.65 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3726  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  25.55 
 
 		 348 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.53 
 
 		 308 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  31.17 
 
 		 339 aa  85.1  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  39.51 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 344 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.47 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  22.59 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  28.97 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.09 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  36.99 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  43.36 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  31.52 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  40.36 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  33.77 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.58 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  24.31 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  22.3 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.87 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.46 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  36.09 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.53 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.76 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  27.5 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.09 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  33.75 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  34.71 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.74 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.19 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.04 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  24.16 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.07 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.48 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  26.17 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  40.15 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.22 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  30.58 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 349 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  31.93 
 
 		 321 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  25.18 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  25.1 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  35.94 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.49 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  29.49 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  29.49 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  28.04 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  41.67 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.49 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.49 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.49 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  41.67 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  29.49 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.49 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  36.42 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.85 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.3 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  40.51 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.12 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  36.09 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  33.14 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.19 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  28.29 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  31.33 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  29.73 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  33.97 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  37.05 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  25.22 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  36.31 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>