259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1238 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1128  hypothetical protein  87.32 
 
 		 284 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0051  ApbE family lipoprotein  40.1 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.252526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6589  ApbE family lipoprotein  40.35 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6144  ApbE family lipoprotein  38.78 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.592047  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0233  ApbE-like lipoprotein  45.73 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0382  ApbE family lipoprotein  39.65 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.529182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.38 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.44 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  36.43 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  37.6 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.54 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.01 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.89 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  36.07 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  37.8 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  29.61 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  34.73 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  36 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.86 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.54 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3924  ApbE-like lipoprotein  31.37 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.54 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  36.22 
 
 		 346 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  39.86 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 353 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.54 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.54 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.99 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  32.21 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  35.54 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.36 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  36.96 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.25 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.67 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  32.57 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  32.52 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  37.78 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0491  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  26.95 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.71 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.33 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  34.88 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  34.71 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.85 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  26.35 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1299  ApbE family lipoprotein  36.36 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.788342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  35.86 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  34.11 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.66 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  30.23 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  35.92 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.46 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  35.16 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.32 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  37.69 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  34.62 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  34.38 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  30 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  30 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  27.91 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.06 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  34.65 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  30.88 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  37.5 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  37.69 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.31 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  23.45 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.41 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.52 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  36.43 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  32.81 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  26.47 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.69 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  36.55 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  30.87 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  36.84 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.23 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  28.02 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  30.16 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>