More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1559 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  81.82 
 
 		 408 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 408 aa  817    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  56.02 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  55.44 
 
 		 402 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  55.99 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  56.14 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  52.48 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  52.33 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  54.03 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  53.4 
 
 		 430 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.81 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  51.94 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  52.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  50.91 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  49.21 
 
 		 417 aa  338  9e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  48.56 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  48.56 
 
 		 419 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  47.66 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  47.34 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  45.26 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  43.95 
 
 		 413 aa  293  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  43.5 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  44.15 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  46.22 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  43.04 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  45.62 
 
 		 378 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  45.36 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.86 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  41.58 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  40.42 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  43.2 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.53 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.24 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  40.31 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  43.18 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  40.79 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  41.36 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  42.17 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.21 
 
 		 390 aa  262  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 426 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.71 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  39.75 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40.91 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  42.07 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  41.16 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  41.31 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.31 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  39.14 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  39.83 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  41.14 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  41.37 
 
 		 424 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  41.38 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.78 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  41.43 
 
 		 449 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  40.82 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  37.97 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  40.21 
 
 		 431 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.57 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  39.01 
 
 		 413 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 418 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  40.41 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  39.26 
 
 		 360 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 		 409 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.59 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  40.58 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  38.62 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  40.31 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  42.7 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  39.23 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 		 375 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  37.78 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  44.41 
 
 		 376 aa  245  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  42.64 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  39.33 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  40.62 
 
 		 423 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>