More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1533 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  65.43 
 
 		 247 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  63.67 
 
 		 246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  62.96 
 
 		 245 aa  325  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.51 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  64.58 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0750  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.67 
 
 		 248 aa  314  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0213  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  63.22 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0135  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 246 aa  294  9e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0181638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 257 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  57.74 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  59.32 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  55.83 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  57.38 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  55.65 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  58.75 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  55.65 
 
 		 363 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  56.2 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.75 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.33 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.42 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  53.09 
 
 		 360 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.02 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  56.07 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.67 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  57.14 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  56.07 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  53.88 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  55.23 
 
 		 269 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  58.02 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.69 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  54.73 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  55 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  54.32 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  53.53 
 
 		 246 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  53.75 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  56.25 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 262 aa  268  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.5 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.42 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  51.67 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.89 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  55 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 284 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.58 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  54.17 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  54.81 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  54.17 
 
 		 266 aa  265  5.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  52.26 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  56.73 
 
 		 246 aa  264  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  53.01 
 
 		 261 aa  264  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 242 aa  264  8e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 269 aa  264  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  53.69 
 
 		 264 aa  263  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.92 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.17 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  52.1 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  53.5 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  54.17 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  52.26 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>