More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1188 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  100 
 
 		 579 aa  1176    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 603 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  35.47 
 
 		 594 aa  276  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  29.93 
 
 		 610 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  31.7 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  39.82 
 
 		 592 aa  226  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 608 aa  220  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  31.19 
 
 		 594 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  29.09 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  28.99 
 
 		 586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 624 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  35.65 
 
 		 622 aa  192  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  30.04 
 
 		 606 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  37.16 
 
 		 625 aa  190  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  34.05 
 
 		 593 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.95 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  33.9 
 
 		 626 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  31.87 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  33.04 
 
 		 618 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  33.13 
 
 		 623 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 618 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  33.96 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  39.02 
 
 		 619 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.55 
 
 		 615 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  42.62 
 
 		 588 aa  177  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  29.35 
 
 		 614 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  39.53 
 
 		 625 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  29.98 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  40.16 
 
 		 611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.58 
 
 		 602 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  25.31 
 
 		 618 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  26.29 
 
 		 616 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  37.35 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  33.41 
 
 		 613 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  32.74 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  29.52 
 
 		 603 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  32.56 
 
 		 584 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.02 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 621 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  34.77 
 
 		 597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  38.04 
 
 		 626 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.64 
 
 		 587 aa  167  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  38.13 
 
 		 627 aa  167  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  40 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.21 
 
 		 613 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.23 
 
 		 595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  38.74 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  35.81 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.91 
 
 		 604 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.21 
 
 		 597 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  37.94 
 
 		 611 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  27.6 
 
 		 611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.17 
 
 		 582 aa  163  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.17 
 
 		 582 aa  163  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.17 
 
 		 582 aa  163  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.64 
 
 		 633 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  29.7 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  37.45 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0066  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 		 579 aa  162  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  38.25 
 
 		 625 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  33.73 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.34 
 
 		 597 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  29.23 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  31.49 
 
 		 727 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  36.46 
 
 		 598 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.72 
 
 		 588 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  36.43 
 
 		 604 aa  160  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  32 
 
 		 608 aa  160  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.06 
 
 		 593 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 582 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 662 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.21 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  35.87 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  40.25 
 
 		 737 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  31.35 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0385  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.39 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0640638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  31.05 
 
 		 734 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.81 
 
 		 582 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  35.89 
 
 		 742 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>