More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4490 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  100 
 
 
389 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  76.9 
 
 
384 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  76.12 
 
 
384 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  75.99 
 
 
384 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  31.12 
 
 
380 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  35.15 
 
 
381 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  34.35 
 
 
355 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  32.73 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  36.24 
 
 
381 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  31.78 
 
 
377 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  29.24 
 
 
398 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  31.04 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  29.22 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.68 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  30.98 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  31.27 
 
 
377 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.04 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  30.26 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  30.67 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  33.24 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  27.94 
 
 
377 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  30.48 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  32.23 
 
 
345 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  29.83 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  31.44 
 
 
379 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  25.94 
 
 
376 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  29.87 
 
 
393 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  26.38 
 
 
368 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  36.15 
 
 
406 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.92 
 
 
393 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  30.81 
 
 
362 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  29.83 
 
 
402 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  33.42 
 
 
347 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.91 
 
 
379 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.09 
 
 
403 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.52 
 
 
376 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  31.2 
 
 
392 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.49 
 
 
391 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  31.05 
 
 
374 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  27.78 
 
 
416 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  32.72 
 
 
357 aa  99.8  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  30.08 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  28.42 
 
 
372 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  31.51 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.76 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.27 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.41 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  29.6 
 
 
387 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  25.06 
 
 
387 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.36 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  31.28 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  33.18 
 
 
414 aa  93.2  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  36.67 
 
 
435 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  25.81 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.23 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  28.87 
 
 
377 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  29.35 
 
 
383 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.23 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  28.12 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  31.47 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.76 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  26.5 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.33 
 
 
406 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  30.39 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  34.22 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  30.25 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  29.92 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  33.47 
 
 
401 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  30.79 
 
 
401 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  32.66 
 
 
381 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  30.27 
 
 
287 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32 
 
 
406 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32 
 
 
406 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.88 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  23.33 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  37.96 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  27.11 
 
 
394 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.61 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  34.47 
 
 
363 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  28.18 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.5 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  29.23 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30.67 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.52 
 
 
432 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  24.32 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  33.53 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  26.7 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.12 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.43 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0489  probable cysteine desulfurase  22.97 
 
 
402 aa  87  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  27.04 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.63 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30.67 
 
 
406 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  30.67 
 
 
406 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.94 
 
 
429 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  29.92 
 
 
385 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>