More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0717 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 434 aa  850    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  39.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  39.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  40.95 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  40.95 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  40.7 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  38.82 
 
 		 430 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 434 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  31.31 
 
 		 433 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  32.94 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  33.77 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  32.1 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  28.67 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 443 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  29.91 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  27.51 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  32.37 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  32.32 
 
 		 764 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  30.83 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  31.5 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 486 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 786 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 		 770 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  27.22 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 716 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  27.35 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 796 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  28.06 
 
 		 745 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 		 820 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  26.84 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.16 
 
 		 437 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1905  amino acid permease-associated region  29.14 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.56 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.48 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  24.84 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.48 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  27.91 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.94 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.48 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  24.84 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.41 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  29.1 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.41 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  24.52 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  27.25 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  27.25 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.07 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.07 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15324  predicted protein  25.68 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.81 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  29.01 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  26.99 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.06 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  27.25 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  28.26 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.98 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  28.32 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>