120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1751 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1751  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00152949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  54.62 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4285  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  45.17 
 
 		 420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 434 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  37.27 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  36.66 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.55 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  36.08 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  33.8 
 
 		 397 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  35.18 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  32.36 
 
 		 417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  33.04 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  32.05 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 386 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  33.04 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 386 aa  136  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 393 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  30.49 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  35.04 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  42.77 
 
 		 222 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  45.4 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  45.4 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  45.4 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  45.4 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  47.4 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4427  major facilitator superfamily transporter  35.24 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.320223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 388 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  29.57 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  33.17 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>