More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1152 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 360 aa  691    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  35.62 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  36.53 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  39.11 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  38.51 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  36.83 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  40.06 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  36.22 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  35.01 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  37.74 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  38.36 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  35.33 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  34.52 
 
 		 404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.87 
 
 		 652 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  36.34 
 
 		 375 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  37.02 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  32.22 
 
 		 652 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  36.08 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  33.05 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  36.41 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  33.05 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.86 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  32.71 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  34.29 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  34.18 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  33.91 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  29.26 
 
 		 666 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.96 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  34 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  29.21 
 
 		 684 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 369 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.9 
 
 		 440 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.17 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  28.14 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.87 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  29.19 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  32.05 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 666 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.74 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  31.49 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.74 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.48 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.6 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.46 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.46 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.46 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  34.17 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  34.97 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  36.67 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  30.86 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  33.87 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.39 
 
 		 1033 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  34.43 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  34.43 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  31.04 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.02 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  33.9 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  32.71 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  32.86 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  29.03 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  29.03 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 		 450 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.81 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.56 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.29 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  34.26 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  34.2 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.09 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.56 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  32.29 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.56 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.06 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  32.46 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  32.46 
 
 		 338 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.18 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 339 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.45 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.05 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>