More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4202 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  42.71 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  42.27 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  42.71 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  42.11 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  44.07 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 		 247 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  36.96 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  41.49 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  42.46 
 
 		 255 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  44.57 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  42.46 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 255 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  42.08 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  39.89 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  41.08 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  43.02 
 
 		 255 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36 
 
 		 296 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  39.67 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 271 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  39.67 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  39.66 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  37.95 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.3 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.78 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  36.1 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  37.91 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 268 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  39.18 
 
 		 240 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  33.33 
 
 		 273 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  43.27 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  41.52 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  41.95 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  37.91 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  36.46 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  33.51 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 245 aa  95.5  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  38.59 
 
 		 256 aa  95.5  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  39.56 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  34.17 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.46 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  37.91 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  30.27 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.67 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  34.21 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 		 246 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.67 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.57 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  38.74 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  36.81 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.67 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.76 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.72 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  37.11 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  35.11 
 
 		 263 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  35.11 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  28.04 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.36 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  36.02 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>