More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1515 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
792 aa  1606    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  31.85 
 
 
389 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  30.03 
 
 
418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  30.6 
 
 
399 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  29.87 
 
 
391 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 
359 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 
391 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.86 
 
 
358 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  28.05 
 
 
362 aa  149  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 
359 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 
360 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  28.23 
 
 
418 aa  145  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 
360 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  29.02 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 
360 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 
356 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  29.4 
 
 
379 aa  129  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 
359 aa  127  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 
356 aa  124  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 
359 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 
361 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 
374 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 
391 aa  121  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.84 
 
 
391 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.91 
 
 
394 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 
403 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.67 
 
 
391 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 
392 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 
388 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.44 
 
 
371 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 
384 aa  114  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 
387 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 
359 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 
364 aa  111  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 
370 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  26.76 
 
 
360 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 
363 aa  108  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 
1040 aa  106  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  25.72 
 
 
417 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.73 
 
 
359 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 
360 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 
441 aa  104  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  25.5 
 
 
360 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  26.02 
 
 
359 aa  104  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.25 
 
 
401 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 
360 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.99 
 
 
384 aa  102  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
380 aa  101  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.85 
 
 
370 aa  100  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.46 
 
 
360 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  28.46 
 
 
366 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.22 
 
 
397 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 
434 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.6 
 
 
442 aa  99  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.49 
 
 
392 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 
358 aa  98.2  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.56 
 
 
401 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.08 
 
 
403 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 
395 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  26.42 
 
 
360 aa  95.5  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 
360 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  26.32 
 
 
365 aa  95.1  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  26.01 
 
 
365 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 
395 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 
359 aa  93.2  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.33 
 
 
371 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 
371 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  24.44 
 
 
365 aa  91.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 
360 aa  91.3  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
370 aa  90.9  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  20.77 
 
 
441 aa  90.9  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
358 aa  90.9  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 
371 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  24.68 
 
 
370 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.43 
 
 
387 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.14 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 
360 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.19 
 
 
389 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
369 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 
370 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 
356 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  26.02 
 
 
356 aa  89.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  26.1 
 
 
361 aa  88.6  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  25.45 
 
 
366 aa  88.6  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 
393 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 
393 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.66 
 
 
356 aa  87.8  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.66 
 
 
356 aa  87.8  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 
379 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 
397 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  23.81 
 
 
372 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  22.49 
 
 
375 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.41 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 
371 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  23.03 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.88 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>