More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1052 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
470 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  63.33 
 
 
455 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  61.09 
 
 
460 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  54.33 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.11 
 
 
453 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.95 
 
 
457 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.95 
 
 
457 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.95 
 
 
457 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  47.06 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.01 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.44 
 
 
453 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.12 
 
 
442 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  46.94 
 
 
461 aa  345  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.57 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.37 
 
 
472 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  45.22 
 
 
479 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  47.11 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  43.81 
 
 
455 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  48.65 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.14 
 
 
496 aa  336  5e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
464 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.92 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.18 
 
 
449 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  45.73 
 
 
455 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  39.35 
 
 
461 aa  319  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.11 
 
 
464 aa  319  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.86 
 
 
462 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  41 
 
 
457 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.33 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.73 
 
 
456 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.41 
 
 
459 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.97 
 
 
456 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.04 
 
 
461 aa  308  9e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  37.74 
 
 
459 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 
461 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.56 
 
 
470 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.59 
 
 
469 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.34 
 
 
470 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  41.69 
 
 
498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.36 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 
462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.7 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.7 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  39.61 
 
 
499 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
466 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.88 
 
 
497 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.81 
 
 
470 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.43 
 
 
460 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  39.83 
 
 
499 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.31 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.81 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.81 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.12 
 
 
470 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.58 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.58 
 
 
470 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.24 
 
 
496 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.05 
 
 
459 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 
488 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  37.36 
 
 
497 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.36 
 
 
470 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.36 
 
 
470 aa  299  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.09 
 
 
453 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.77 
 
 
488 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.43 
 
 
466 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.75 
 
 
459 aa  297  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
497 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.04 
 
 
460 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 
460 aa  296  5e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.65 
 
 
461 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  42.92 
 
 
481 aa  295  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  37.14 
 
 
497 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  38.17 
 
 
499 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 
497 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  38.21 
 
 
499 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  37.77 
 
 
499 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  39.95 
 
 
497 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  46.26 
 
 
447 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  39.48 
 
 
499 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.16 
 
 
459 aa  293  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.48 
 
 
497 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  37.77 
 
 
497 aa  292  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.01 
 
 
461 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.97 
 
 
459 aa  291  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  39.5 
 
 
499 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  39.91 
 
 
499 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.16 
 
 
459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  37.55 
 
 
499 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.67 
 
 
497 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  37.97 
 
 
497 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  36.7 
 
 
499 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  37.72 
 
 
499 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.2 
 
 
501 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.33 
 
 
459 aa  289  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 
471 aa  288  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  38.72 
 
 
485 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  43.08 
 
 
441 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.95 
 
 
499 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.29 
 
 
495 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  44.94 
 
 
451 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.29 
 
 
495 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>