More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0609 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  100 
 
 
495 aa  942    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  69.32 
 
 
480 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  30.62 
 
 
491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  47.54 
 
 
400 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  56.57 
 
 
204 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
452 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.47 
 
 
292 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.16 
 
 
388 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
319 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  48.98 
 
 
438 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  43.38 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  46.4 
 
 
347 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  39.58 
 
 
228 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  43.52 
 
 
337 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  53.75 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
432 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  51.46 
 
 
370 aa  89.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  41.67 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  45.86 
 
 
256 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  41.67 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  45.86 
 
 
256 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  36.3 
 
 
337 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  45.11 
 
 
248 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
231 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  40.98 
 
 
265 aa  87.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
256 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
388 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.98 
 
 
374 aa  86.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.76 
 
 
222 aa  86.7  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  42.86 
 
 
256 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
256 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
199 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  47.32 
 
 
256 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  49.46 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  49.46 
 
 
190 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1504  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
188 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0399794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.34 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1828  lipoprotein, NLP/P60 family  43.12 
 
 
188 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.996382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  42.36 
 
 
225 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  37.76 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  43.66 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  39.1 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  39.1 
 
 
221 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  38.16 
 
 
239 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  43.97 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  41.32 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  40.37 
 
 
197 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  46.73 
 
 
164 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.26 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  44.55 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  38.41 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  45.79 
 
 
253 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  44.07 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  45.71 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  39.05 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  52.53 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  44.07 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.4 
 
 
340 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.69 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  41.32 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  45.56 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.88 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  37.68 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  40.31 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.85 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  45.24 
 
 
337 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  35.62 
 
 
162 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  36.84 
 
 
479 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
173 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  41.12 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.44 
 
 
281 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  38.64 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  43.48 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.57 
 
 
333 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  39.66 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  38.24 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  42.45 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  36.88 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  45.63 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>