More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0178 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  84.98 
 
 		 236 aa  327  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  50.7 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  45.33 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  45.1 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  43.96 
 
 		 232 aa  141  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  41.21 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  40.89 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  45.73 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  39.7 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  36.71 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  40.12 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.02 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1568  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>