More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0125 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
288 aa  573  1e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.66 
 
 
297 aa  213  3e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  44.48 
 
 
291 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 
301 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.94716e-07  hitchhiker  6.11237e-05 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 
298 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.01 
 
 
298 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
306 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  3.09577e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 
300 aa  134  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  29.93 
 
 
306 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
293 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
290 aa  121  1e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 
303 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 
293 aa  115  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  32.62 
 
 
307 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  33.09 
 
 
297 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.6 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.6 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.22 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.6 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.62 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.2 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  32.83 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.94 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.63 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.63 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.63 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.63 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.63 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.23 
 
 
310 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.56 
 
 
316 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.23 
 
 
310 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.72 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  33.66 
 
 
529 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.66 
 
 
529 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  31.27 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
223 aa  81.6  1e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 
282 aa  80.9  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
303 aa  80.9  2e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
259 aa  81.3  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 
265 aa  79.7  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 
279 aa  79.7  5e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 
250 aa  79  8e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  25.11 
 
 
279 aa  78.6  1e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  33.77 
 
 
289 aa  78.6  1e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 
546 aa  77.4  3e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
304 aa  76.6  4e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
359 aa  76.6  5e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 
326 aa  76.3  6e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 
284 aa  76.3  6e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  23.08 
 
 
250 aa  75.9  8e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  40.4 
 
 
284 aa  75.1  1e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 
286 aa  75.1  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
299 aa  73.9  3e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  20.58 
 
 
273 aa  73.9  3e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 
285 aa  73.9  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  27.88 
 
 
303 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  27.88 
 
 
303 aa  73.6  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  27.88 
 
 
303 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  27.88 
 
 
303 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  27.88 
 
 
303 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25.35 
 
 
537 aa  73.2  5e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 
292 aa  73.2  5e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 
544 aa  72.8  6e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.65 
 
 
298 aa  72.8  6e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  22.98 
 
 
278 aa  72.8  6e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 
202 aa  72.4  7e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
303 aa  72.4  8e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
313 aa  71.6  1e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  28.43 
 
 
530 aa  72  1e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
289 aa  71.6  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 
331 aa  72  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  22.69 
 
 
261 aa  70.9  2e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
288 aa  70.9  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 
276 aa  70.9  2e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  34.31 
 
 
304 aa  70.9  2e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  25.85 
 
 
294 aa  71.6  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 
293 aa  70.5  3e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 
273 aa  70.5  3e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.16038e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
532 aa  70.5  3e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 
309 aa  70.5  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.1 
 
 
294 aa  70.1  4e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 
1201 aa  70.1  4e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
355 aa  70.1  4e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.62622e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 
278 aa  69.7  5e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 
306 aa  69.3  6e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
292 aa  69.7  6e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 
350 aa  69.3  7e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 
288 aa  69.3  7e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 
773 aa  69.3  8e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  22.05 
 
 
288 aa  68.9  9e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.58 
 
 
319 aa  68.9  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 
316 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
310 aa  68.9  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  9.84991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  33.67 
 
 
299 aa  67.8  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>