More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1373 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1373  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
338 aa  658    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0579  oxidoreductase domain-containing protein  48.93 
 
 
369 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0257  oxidoreductase domain protein  45.4 
 
 
367 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02190  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05360  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0050  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  32.66 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  25.36 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.11 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  32.35 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  36.43 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  33.5 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  25.84 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  34.09 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5877  dehydrogenase-like protein  32.13 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00938562  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1814  inositol 2-dehydrogenase  30.3 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1265  inositol 2-dehydrogenase  26.4 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218525  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  37.72 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 
360 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  36.11 
 
 
353 aa  62.8  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  32.96 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  31 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  30 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1026  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  35.18 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  36.92 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
358 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.59 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.09 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  29.5 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  34.59 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  37.82 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.09 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.82 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  33.87 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  27.34 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  33.79 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3701  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 
458 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  28.97 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  34.27 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.49 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2488  inositol 2-dehydrogenase  31.82 
 
 
334 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.4809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37800  predicted dehydrogenase  43.8 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1716  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  0.303463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  34.95 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  32.59 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.39 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  33.85 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  33.8 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.98 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  32.99 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 
400 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  36.92 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.37 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 
385 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  35.85 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4060  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2104  oxidoreductase domain protein  35.51 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0979872  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  30.43 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4486  Inositol 2-dehydrogenase  30.1 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.910822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>