169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_R0011 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  89.87 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  88.61 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  92.16 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  89.09 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.011451  normal  0.263113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0023  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0030  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.512133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  0.0114921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0012  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>