299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0862 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  92.65 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  87.65 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  88.52 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  86.49 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1288  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14570  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60280  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39518  normal  0.0378684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0034  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159926  normal  0.424933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0051  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000403882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.207136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA20  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R73  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0032  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.624579  normal  0.3525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000612971 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0063  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>