228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_R0022 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  95.74 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0015  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0118  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t075  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000081141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>