214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0021 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  95.6  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  90.74 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0039  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.73025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0041  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0028  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0046  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.470229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0039  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02662  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0081  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0009  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  84 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>