168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0003 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0016  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>