296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_R0069 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  98.48 
 
 		 85 bp  123  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  94.2 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  94.2 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  99.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  93.85 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  92.75 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0037  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21797  normal  0.0832006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0039  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368891  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0039  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00836126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0038  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00398477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  98.08 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  98.04 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0016  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0041  tRNA-Leu  92.19 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.264208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  96.08 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  100 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  79.8  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  94.23 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  94.23 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  79.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  94.23 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  94.23 
 
 		 87 bp  79.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0029  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0025  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.426902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4321  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0093  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0031  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.926824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_003295  RS03938  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0015  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0022  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0021  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144859  normal  0.471234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0025  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.132297  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>