159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0029 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 88 bp  95.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  89.77 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0026  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000397125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>