187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2526 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  97.62 
 
 
84 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  98.59 
 
 
82 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  98.59 
 
 
82 bp  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  97.14 
 
 
81 bp  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.14 
 
 
84 bp  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.14 
 
 
84 bp  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  97.14 
 
 
84 bp  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.14 
 
 
84 bp  123  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  97.14 
 
 
81 bp  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  97.14 
 
 
86 bp  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  97.14 
 
 
81 bp  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  97.14 
 
 
81 bp  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  97.14 
 
 
81 bp  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.22 
 
 
83 bp  121  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  94.29 
 
 
81 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  101  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  93.33 
 
 
82 bp  101  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  95 
 
 
82 bp  87.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  87.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  95 
 
 
82 bp  87.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  83.8  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  97.73 
 
 
82 bp  79.8  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0293749  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0175  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0416  tRNA-Leu  90.14 
 
 
82 bp  77.8  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0685783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  97.67 
 
 
80 bp  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  97.62 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  89.23 
 
 
86 bp  73.8  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  95.56 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  86.08 
 
 
84 bp  69.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  97.44 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  85.9 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  89.66 
 
 
84 bp  67.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  97.3 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  88.41 
 
 
82 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  97.3 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  95 
 
 
83 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0026  tRNA-Leu  91.07 
 
 
81 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000829114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  93.02 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  97.14 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  88.89 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  94.74 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  92.68 
 
 
82 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  92.68 
 
 
82 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.5 
 
 
83 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0043  tRNA-Leu  92.5 
 
 
83 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.45142e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  85 
 
 
85 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  86.49 
 
 
85 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 
82 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  85 
 
 
85 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  86.57 
 
 
85 bp  54  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  94.87 
 
 
86 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0041  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000041426  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 
83 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  86.36 
 
 
85 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  92.11 
 
 
82 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  92.11 
 
 
85 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>