64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0024 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0026  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000397125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333155  hitchhiker  0.000426709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240942  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>