145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0008 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t39  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1876  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0009  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.763492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0014  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0035  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2315  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0030  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 84 bp  58  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  85.23 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt12  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt12  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  83.15 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  84.21 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>