26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0031 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  98.39 
 
 
86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  96.88 
 
 
87 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  90.7 
 
 
83 bp  54  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  96.67 
 
 
84 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  89.13 
 
 
86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  93.75 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  93.75 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  89.36 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  93.75 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  93.55 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  86.96 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>