75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0019 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3345  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2501  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361468  hitchhiker  0.00416301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.331877  hitchhiker  0.00233917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075209  normal  0.504516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0099  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0049  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0059  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0038  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0041  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0035  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.443555  hitchhiker  0.0011372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0043  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.025828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0021  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0535721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0017  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.347732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0014  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.582798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0014  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0055  tRNA-Leu  85 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97975  normal  0.23732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0032  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0756362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0064  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>