33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0024 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0014  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0015  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4002  hypothetical protein  96.43 
 
 		 417 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224316  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0044  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.450605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000776384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt12  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>