14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0044 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872486  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.243975  normal  0.0115468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.654797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>