28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 86 bp  97.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>