32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_R0049 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  87.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  82.93 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>