49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0045 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 83 bp  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 84 bp  81.8  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24950  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742727  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>