298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0053 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 76 bp  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  97.26 
 
 		 75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0036  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000134783  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0014  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_639  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0036  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000263314  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>