299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt52 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt36  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt36  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0034  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.793072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0030  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0040  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0053459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0020  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.748277  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0017  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14880  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.67591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0023  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0016  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0020  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0016  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0044  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.363029  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14032  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00820  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.193578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0024  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0041  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00225081  hitchhiker  0.00893878 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000219569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>