299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0042 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  94.52 
 
 
75 bp  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  90.41 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  90.41 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0036  tRNA-Gly  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  89.04 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0035  tRNA-Gly  88.71 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0036  tRNA-Gly  88.71 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0019  tRNA-Gly  87.67 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0008  tRNA-Gly  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  86.3 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0025  tRNA-Gly  93.18 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.157688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.62 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.62 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  93.62 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  93.62 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  93.62 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  86.49 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  84.93 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  84.93 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  95 
 
 
71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  95 
 
 
71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0050  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00077941  normal  0.344918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590805  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0037  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0495451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0041  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00162631  normal  0.347035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0043  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00341468  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0044  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.013329  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1741  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0350949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1742  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0559851  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000173498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0036  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000574217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0037  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000566615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0036  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.19079  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0036  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0033  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0034  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207428  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  86.49 
 
 
73 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2454  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.880044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2826  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0217259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2827  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2766  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0786611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2767  tRNA-Gly  86.49 
 
 
76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0513521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>