298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0014 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  89.61 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0027  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0034  tRNA-Arg  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000649431  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0431  tRNA-Ala  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.147993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0014  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_002950  PGt11  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0034  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0035  tRNA-Asp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0062  tRNA-Asp  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000079557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  93.02 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0331  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.222457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0053  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000638306  hitchhiker  0.00279768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>