232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt09 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0331  tRNA-Gly  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R32  tRNA-Gly  91.94 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0036  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0180  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0011  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000624107  normal  0.164759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0089  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.548412  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  85.94 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>