207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0180 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0036  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0180  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303819  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  92.96 
 
 
71 bp  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  95 
 
 
71 bp  95.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  90.91 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0023  tRNA-Gly  89.55 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.021733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  89.55 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  91.38 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  88.06 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  88.71 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  92 
 
 
71 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2236  tRNA-Gly  89.66 
 
 
75 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  87.93 
 
 
71 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  86.67 
 
 
74 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  94.44 
 
 
74 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  94.44 
 
 
74 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0331  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.222457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  94.44 
 
 
74 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  94.44 
 
 
141 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  87.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  92.31 
 
 
74 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  94.29 
 
 
74 bp  54  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0007  tRNA-Gly  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000010318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0005  tRNA-Gly  94.29 
 
 
74 bp  54  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  87.27 
 
 
71 bp  54  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  87.27 
 
 
74 bp  54  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0012  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  85.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  91.67 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  91.67 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>