266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_R0036 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0036  tRNA-Gly  95 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0180  tRNA-Gly  95 
 
 		 71 bp  95.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303819  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt09  tRNA-Gly  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0331  tRNA-Gly  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0023  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.021733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2236  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>