More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0029 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>