282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2370 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  97.22 
 
 		 74 bp  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0056  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126363  hitchhiker  0.0000037028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0007  tRNA-Gly  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000068368  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0048  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>