256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0057 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>