250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_R0059 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  88 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  88 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 66 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0043  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>