174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0006 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 66 bp  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  95.83 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t17  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0049  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.099885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0956  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0037  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0154  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693037  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0011  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0199  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  96.55 
 
 		 141 bp  50.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0008  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  0.0304222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0063  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0150  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000645582  hitchhiker  0.00000000139269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0015  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000368729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>