251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_R0031 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  98.59 
 
 		 71 bp  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  98.59 
 
 		 71 bp  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  97.18 
 
 		 71 bp  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0023  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185917  normal  0.670849 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0701067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0019  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0052  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>